Gao Lab
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2018年3月24日 yangdc

在线服务

为方便生物学家使用,课题组主持开发了系列在线服务。

基因表达的功能及演化

  • 单细胞转录组检索算法Cell BLAST
  • 转录本表达即时计算算法LocExpress
  • 编码潜能预测算法CPC2 (Mirror),亦可使用老版本CPC1 (Mirror)
  • 长非编码RNA功能注释工具AnnoLnc
  • 人类长非编码RNA参考功能注释数据库RefLnc
  • 人胚胎干细胞长非编码RNA数据库SCBrowse
  • 植物转录因子数据库PlantTFDB (Mirror)
  • 植物转录调控平台PlantRegMap (Mirror)

面向遗传变异的精准医学

  • 遗传变异功能注释工具包COPE (Mirror):编码区变异 (Mirror)、调控区变异 (Mirror)
  • 基因结构可视化工具GSDS (Mirror)
  • Cas9 gRNA靶位点预测算法CasOT:与北京大学生命科学学院张博课题组合作完成
  • 中国食管癌变异数据库CCGD/ESCC:与肿瘤医院吴晨课题组合作完成

同时,课题组还以开源方式,开放了部分分析、计算与可视化平台,供研究人员免费使用。

  • 在线生物信息学实验室WebLab
  • 基因组浏览器框架ABrowse
  • 轻量级多机计算框架ABCGrid

网站语言

  • EnglishEnglish
  • 中文 (中国)中文 (中国)

链接

  • 北京未来基因诊断高精尖创新中心 (ICG)
  • 北京大学生物医学前沿创新中心 (BIOPIC)
  • 北京大学生物信息中心(CBI)
  • 北京大学生命科学学院
  • 蛋白质与植物基因研究国家重点实验室
  • 北京大学科学与工程计算中心 (CCSE)

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